Mapix®  
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Gridding and flagging


Visualisation de la segmentation

Mapix® est un logiciel d'analyse d'images de microarrays combinant les outils d'imagerie et d'analyse, alliant simplicité d'utilisation, convivialité et haute performance.
Mapix® possède toutes les fonctionnalités les plus récentes afin d'explorer rapidement les données de vos expériences de microarrays avec un haut niveau de fiabilité et une optimisation de votre productivité.

  • Le Gridding (alignement automatique) rapide et pertinent grâce à un algorithme efficace qui recherche automatiquement chaque spot et réalise un alignement optimal de la grille.
  • La segmentation automatique des spots (sélection des pixels pertinents ou utiles et élimination des autres) assure une haute qualité des données expérimentales.
  • La performance de gridding et des calculs de quantification est adaptée à la haute résolution de l'InnoScan®700 (3μm) et donc à la taille des images en résultant.

 
 

Interface multi-fenêtres

Mapix® a été conçu pour offrir aux utilisateurs une visualisation optimale et une rapidité d'apprentissage grâce à une disposition des commandes très interactive présentant une complète corrélation entre les données sous différents tracés.

Mapix® offre une adaptabilité maximale afin de suivre les besoins des utilisateurs.
 

  • Mapix® possède une compatibilité avec une large variété de biopuces (Staggered/Orange Packing, Protein, aCGH, ...) venant de différents fournisseurs mais aussi de biopuces spottées maison mais sa fonction création de grille lui permet une compatibilité avec tous les formats de biopuces.
  • Un Batch Processing augmente la productivité en rendant efficace l'analyse d'un grand nombre de biopuces par jour. (Disponible sur Version 3.0.0)
  • Le marquage automatique des spots permet de marquer les sopts selon ses propres critères. (disponible à partir de la Version 3.5.0)
  • La gestion des plugins est un moyen pour l'utilisateur d'intégrer ses propres applications à Mapix. (disponible à partir de la Version 4.0.0)
  • Une évolution constante du logiciel est accessible par internet afin de toujours mieux répondre aux attentes des utilisateurs. (Mises à jour offertes pendant un an)

 
 

Pilôtage & Configuration de l'InnoScan® 700
 

Mapix® dispose d'une automatisation complète ou modulable :

  • Du pilotage des scanners INNOPSYS (InnoScan® 700, 900 et AutoLoader).
  • De l'enregistrement des configurations (paramètres de lecture et d'analyse).
  • De la lecture du code barre situé sur la biopuce.
  • Du contròle de qualité par flagging.

 
 

Visualisation des données exportables
 
 

Mapix® possède une adéquation parfaite avec les formats usuels et tous les types de plateformes.

  • Mapix® intègre les fichiers GAL et transcrit ses résultats enregistrables au format texte et GPR.
  • Un enregistrement des images acquises en tant qu'images TIFF 16 bits avec tous les paramètres de lectures (taille de pixel, puissance laser, ...) et possibilité de faire une copie au format JPEG.
  • Mapix® permet l'analyse d'images en fichier TIFF 16 bits provenant de divers scanners.
  • Mapix®, plate-forme indépendante, est disponible sous les systèmes d'exploitation 32 et 64 bits (Windows, Linux et bientôt Mac).